Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms