Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gata4Q08369 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms