Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a2Q07643 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms