Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms