Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sox9Q04887 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sox9Q04887 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sox9Q04887 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sox9Q04887 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms