Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms