Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms