Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms