Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GscQ02591 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GscQ02591 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GscQ02591 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GscQ02591 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms