Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp1Q01514 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms