Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms