Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms