Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms