Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms