Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms