Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SmsP97355 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmsP97355 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmsP97355 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmsP97355 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms