Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms