Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H3f3aP84244 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H3f3aP84244 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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