Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Irx1P81068 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Irx1P81068 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irx1P81068 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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