Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeboxP70368 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms