Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms