Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms