Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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