Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hps5P59438 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms