Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms