Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pcbp4P57724 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pcbp4P57724 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms