Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp2c39P56656 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms