Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrp1P56183 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms