Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb3P54754 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb3P54754 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms