Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PctpP53808 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PctpP53808 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PctpP53808 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PctpP53808 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms