Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k1P53349 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms