Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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