Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SqleP52019 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SqleP52019 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SqleP52019 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SqleP52019 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SqleP52019 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SqleP52019 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SqleP52019 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SqleP52019 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SqleP52019 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms