Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfP51642 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfP51642 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfP51642 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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