Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa6P50704 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms