Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf19aP50636 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms