Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpdP50404 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms