Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmod1P49813 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms