Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtpreP49446 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtpreP49446 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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