Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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