Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Epb41P48193 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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