Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms