Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms