Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms