Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd4P46935 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd4P46935 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms