Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tulp2P46686 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms