Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms