Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms