Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc5P32043 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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