Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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